שכונת "נאות פרס" שוכנת בסמיכות לחוף הים התיכון ובמורדות הר הכרמל. השכונה למעשה היא תצרף של סביבת חיים מגוונת, הר הכרמל, שדה בור וחוף הים וסביבתו המעניינת. מתוך קירבה זו הוחלט על שיתוף פעולה עם המכון הביולוגי בו תלמידינו ייהנו מתהליכי לימוד בכיתה וימשיכו בתהליכי חקר עם המורים המוכשרים לכך מהמכון. נכתבה תוכנית לימודים יחודית כרמל וים. התלמידים בשכבת ד' יחקרו את הטבע העירוני במורדות הר הכרמל הסמוך לבית הספר.
ושכבות ה-ו יחקרו את התנאים הביוטיים ואביטיים של חוף הים התיכון הנשקף מבית הספר והשכונה.
מתוך אמונה בכוחה של שיתוף הפעולה של הצוות החינוכי עם מורי המכון הביולוגי להוביל את תהליך הלמידה החוץ כיתתי.